A APCA é dirigida por uma Comissão Diretiva, cujos membros são eleitos de dois em dois anos. A eleição dos membros da Mesa da Assembleia Geral, da Comissão Diretiva e do Conselho Fiscal é feita por escrutínio secreto, direto e universal. Os atuais Corpos Sociais da APCA tomaram posse a 1 de Janeiro de 2025.

A APCA organiza de dois em dois anos a conferência internacional “Portuguese Conference on Automatic Control – CONTROLO’xx”. As conferências CONTROLO’xx tiveram a sua génese no designado “1º Encontro Português de Controlo Automático – CONTROLO’94”, realizado entre os dias 14 e 16 de Setembro de 1994, no Instituto Superior Técnico. Este primeiro encontro, ainda de âmbito nacional, teve o mérito de aproximar a comunidade científica portuguesa, grupos de investigação e a indústria, que realizavam trabalho na área do controlo automático. Desde então, as conferências CONTROLO’xx, atualmente de âmbito internacional, realizam-se por todo o país e atraem um número significativo de participantes. O evento funciona como um importante fórum para a apresentação de trabalhos de investigação e desenvolvimento na área do controlo automático, tendo tido nas últimas edições uma considerável participação industrial.